Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HADHBP55084 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HADHBP55084 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HADHBP55084 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HADHBP55084 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HADHBP55084 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HADHBP55084 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HADHBP55084 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HADHBP55084 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HADHBP55084 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HADHBP55084 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HADHBP55084 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HADHBP55084 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HADHBP55084 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HADHBP55084 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HADHBP55084 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHBP55084 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHBP55084 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHBP55084 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHBP55084 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHBP55084 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHBP55084 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHBP55084 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHBP55084 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HADHBP55084 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HADHBP55084 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHBP55084 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHBP55084 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHBP55084 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHBP55084 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms