Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPP55072 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPP55072 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VCPP55072 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPP55072 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPP55072 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPP55072 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPP55072 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPP55072 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPP55072 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPP55072 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPP55072 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPP55072 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPP55072 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPP55072 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPP55072 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPP55072 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPP55072 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPP55072 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPP55072 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPP55072 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPP55072 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPP55072 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPP55072 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPP55072 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPP55072 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPP55072 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPP55072 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPP55072 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPP55072 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms