Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms