Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRYBA4P53673 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms