Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX2P52951 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX2P52951 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX2P52951 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBX2P52951 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBX2P52951 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBX2P52951 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBX2P52951 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBX2P52951 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBX2P52951 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBX2P52951 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms