Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP98P52948 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP98P52948 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP98P52948 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP98P52948 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP98P52948 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP98P52948 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP98P52948 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP98P52948 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP98P52948 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP98P52948 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUP98P52948 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUP98P52948 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP98P52948 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP98P52948 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP98P52948 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP98P52948 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP98P52948 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP98P52948 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP98P52948 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP98P52948 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP98P52948 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP98P52948 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP98P52948 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP98P52948 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP98P52948 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms