Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA4P52798 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA4P52798 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms