Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms