Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGDP52209 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGDP52209 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGDP52209 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGDP52209 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PGDP52209 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGDP52209 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGDP52209 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGDP52209 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGDP52209 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGDP52209 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PGDP52209 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGDP52209 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGDP52209 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGDP52209 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGDP52209 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGDP52209 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGDP52209 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms