Protein–RNA interactions for Protein: P49913

CAMP, Cathelicidin antimicrobial peptide, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMPP49913 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMPP49913 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMPP49913 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMPP49913 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMPP49913 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMPP49913 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMPP49913 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMPP49913 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMPP49913 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMPP49913 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMPP49913 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMPP49913 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMPP49913 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMPP49913 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms