Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRIM1P49642 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms