Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LHX1P48742 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LHX1P48742 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LHX1P48742 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX1P48742 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX1P48742 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX1P48742 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX1P48742 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX1P48742 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX1P48742 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX1P48742 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX1P48742 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX1P48742 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX1P48742 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX1P48742 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX1P48742 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX1P48742 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX1P48742 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX1P48742 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX1P48742 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX1P48742 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX1P48742 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX1P48742 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX1P48742 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX1P48742 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX1P48742 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX1P48742 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX1P48742 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX1P48742 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX1P48742 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX1P48742 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
LHX1P48742 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX1P48742 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms