Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
RANGAP1P46060 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RANGAP1P46060 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms