Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSKP43235 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSKP43235 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSKP43235 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSKP43235 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSKP43235 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSKP43235 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSKP43235 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSKP43235 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSKP43235 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSKP43235 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSKP43235 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSKP43235 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSKP43235 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms