Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A2P43004 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A2P43004 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms