Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP2P42575 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP2P42575 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP2P42575 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP2P42575 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP2P42575 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP2P42575 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP2P42575 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP2P42575 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP2P42575 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP2P42575 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP2P42575 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP2P42575 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP2P42575 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP2P42575 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP2P42575 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP2P42575 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP2P42575 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP2P42575 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP2P42575 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms