Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR1BP42025 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms