Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRLP40313 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRLP40313 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTRLP40313 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTRLP40313 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTRLP40313 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRLP40313 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms