Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP62P37198 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP62P37198 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP62P37198 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP62P37198 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP62P37198 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP62P37198 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP62P37198 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP62P37198 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP62P37198 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP62P37198 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP62P37198 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP62P37198 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP62P37198 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP62P37198 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP62P37198 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP62P37198 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP62P37198 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP62P37198 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms