Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CFHR2P36980 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms