Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYKP34925 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RYKP34925 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RYKP34925 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RYKP34925 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RYKP34925 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RYKP34925 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RYKP34925 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RYKP34925 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RYKP34925 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RYKP34925 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RYKP34925 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RYKP34925 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RYKP34925 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RYKP34925 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RYKP34925 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RYKP34925 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RYKP34925 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYKP34925 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RYKP34925 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms