Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
ABCC1P33527 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms