Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG3P32926 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG3P32926 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG3P32926 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG3P32926 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG3P32926 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG3P32926 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG3P32926 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG3P32926 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG3P32926 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG3P32926 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG3P32926 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG3P32926 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG3P32926 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG3P32926 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG3P32926 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG3P32926 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms