Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA6P31267 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA6P31267 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA6P31267 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA6P31267 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA6P31267 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA6P31267 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA6P31267 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms