Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBL1P28749 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBL1P28749 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBL1P28749 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBL1P28749 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBL1P28749 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBL1P28749 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBL1P28749 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBL1P28749 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms