Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXP28300 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXP28300 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LOXP28300 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LOXP28300 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LOXP28300 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXP28300 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXP28300 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXP28300 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms