Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DMAP28067 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms