Protein–RNA interactions for Protein: P24530

EDNRB, Endothelin receptor type B, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDNRBP24530 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDNRBP24530 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EDNRBP24530 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms