Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S100A1P23297 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
S100A1P23297 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
S100A1P23297 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
S100A1P23297 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
S100A1P23297 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
S100A1P23297 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
S100A1P23297 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
S100A1P23297 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
S100A1P23297 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
S100A1P23297 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
S100A1P23297 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
S100A1P23297 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
S100A1P23297 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms