Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms