Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATF6P18850 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6P18850 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6P18850 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6P18850 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6P18850 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms