Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms