Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRAFP15056 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRAFP15056 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRAFP15056 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRAFP15056 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRAFP15056 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRAFP15056 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRAFP15056 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRAFP15056 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRAFP15056 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRAFP15056 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRAFP15056 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRAFP15056 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRAFP15056 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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