Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFTRP13569 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFTRP13569 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFTRP13569 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CFTRP13569 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFTRP13569 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFTRP13569 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFTRP13569 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CFTRP13569 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CFTRP13569 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CFTRP13569 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFTRP13569 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFTRP13569 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFTRP13569 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CFTRP13569 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFTRP13569 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CFTRP13569 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFTRP13569 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFTRP13569 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFTRP13569 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFTRP13569 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFTRP13569 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFTRP13569 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFTRP13569 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFTRP13569 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFTRP13569 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFTRP13569 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFTRP13569 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFTRP13569 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFTRP13569 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFTRP13569 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFTRP13569 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFTRP13569 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFTRP13569 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFTRP13569 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFTRP13569 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFTRP13569 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFTRP13569 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
CFTRP13569 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CFTRP13569 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CFTRP13569 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CFTRP13569 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFTRP13569 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFTRP13569 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFTRP13569 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFTRP13569 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CFTRP13569 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFTRP13569 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFTRP13569 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFTRP13569 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFTRP13569 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CFTRP13569 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFTRP13569 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFTRP13569 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFTRP13569 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFTRP13569 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFTRP13569 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFTRP13569 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CFTRP13569 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFTRP13569 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFTRP13569 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFTRP13569 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CFTRP13569 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFTRP13569 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFTRP13569 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFTRP13569 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms