Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC4P0CG21 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms