Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSN3P07498 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSN3P07498 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN3P07498 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN3P07498 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN3P07498 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN3P07498 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN3P07498 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN3P07498 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN3P07498 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSN3P07498 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSN3P07498 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSN3P07498 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms