Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCAP05165 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCAP05165 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCAP05165 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCAP05165 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCAP05165 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCAP05165 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCAP05165 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCAP05165 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCAP05165 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCCAP05165 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCCAP05165 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCCAP05165 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCCAP05165 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCCAP05165 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCCAP05165 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCCAP05165 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCAP05165 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCAP05165 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCAP05165 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCAP05165 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCAP05165 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCCAP05165 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCAP05165 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCAP05165 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCAP05165 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCAP05165 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms