Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A1P05023 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A1P05023 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1P05023 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1P05023 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1P05023 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1P05023 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1P05023 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1P05023 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A1P05023 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1P05023 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms