Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTNP04004 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTNP04004 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTNP04004 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTNP04004 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTNP04004 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTNP04004 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VTNP04004 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTNP04004 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTNP04004 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTNP04004 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTNP04004 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTNP04004 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VTNP04004 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VTNP04004 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VTNP04004 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTNP04004 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms