Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DRAP01903 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DRAP01903 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms