Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL1O95922 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms