Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP29O95721 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms