Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOL3O95236 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOL3O95236 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOL3O95236 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOL3O95236 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOL3O95236 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOL3O95236 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOL3O95236 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOL3O95236 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOL3O95236 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOL3O95236 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOL3O95236 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOL3O95236 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL3O95236 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL3O95236 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL3O95236 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL3O95236 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL3O95236 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms