Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRMUO75648 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMUO75648 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMUO75648 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMUO75648 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMUO75648 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMUO75648 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMUO75648 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMUO75648 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms