Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TIMM17BO60830 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms