Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms