Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTATSF1O43719 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms