Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 27.3
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RBFOX2O43251 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 PTPRK-216ENST00000524481 3157 ntTSL 29.52□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 PTPRK-219ENST00000531050 2515 ntTSL 1 (best)6.77□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 214.01□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-210ENST00000423229 1807 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 AFDN-216ENST00000503021 581 ntTSL 43.09□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 27.3
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RBFOX2O43251 DPP7-207ENST00000473703 684 ntTSL 314.88□□□□□ -0.034e-11■■■■■ 27.3
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RBFOX2O43251 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.429e-11■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)12.03□□□□□ -0.489e-11■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.59e-11■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.569e-11■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.569e-11■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 310.9□□□□□ -0.669e-11■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 SF1-206ENST00000413725 843 ntTSL 210.48□□□□□ -0.739e-11■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.779e-11■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 27.3
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RBFOX2O43251 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.761e-9■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.71e-9■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 27.2
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RBFOX2O43251 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.351e-12■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-12■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-12■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-12■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.61e-12■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-12■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 CAMKK2-216ENST00000545538 3797 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-12■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.491e-14■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.017e-8■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 COBLL1-212ENST00000456171 1793 ntTSL 213.48□□□□□ -0.257e-8■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 COBLL1-219ENST00000491126 604 ntTSL 413.25□□□□□ -0.297e-8■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.627e-8■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.737e-8■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 COBLL1-204ENST00000409184 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.92□□□□□ -1.147e-8■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 ARL2BP-203ENST00000563234 1416 ntTSL 27.79□□□□□ -1.161e-14■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.227e-8■■■■■ 27.2
RBFOX2O43251 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 512.03□□□□□ -0.488e-10■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.98e-10■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 FGFR4-214ENST00000513166 594 ntTSL 416.82■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 FGFR4-216ENST00000514472 552 ntTSL 416.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 FGFR4-212ENST00000510911 709 ntTSL 416.3■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 FGFR4-204ENST00000426612 712 ntTSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 FGFR4-209ENST00000507708 476 ntTSL 316.06■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 FGFR4-211ENST00000509511 1341 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 414.05□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 CTTN-210ENST00000525852 1470 ntTSL 59.65□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-23■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-23■■■■■ 27.1
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