Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms