Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6AO15550 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6AO15550 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms